國內首款“蘭大·華羊芯”投入產(chǎn)業(yè)化應用 填補全球綿羊基因組選擇育種空白 目前市場訂單達6.9萬張
蘭州大學草地農業(yè)科技學院反芻動物研究所王維民教授團隊近日發(fā)布國內首款基于大規(guī)模基因組選擇參考群的高性能綿羊基因組育種芯片“蘭大·華羊芯”,這是該團隊組織實施的“綿羊雙萬羊基因組計劃”的第一階段重大成果,。
近年來,,基因組育種技術在動植物育種中得到廣泛應用,,加速了全球農用動物的遺傳改良,。我國在羊基因組育種方面落后于國外,,也落后于國內豬,、禽,、牛等畜種,。為改變我國綿羊基因組育種技術落后的局面,在王維民教授和樂祥鵬教授組織下,,至今歷時9年,,累計投入23.5萬人時,通過持續(xù)精準的大規(guī)模性能測定與基因組重測序,,率先在國內構建規(guī)模達10318只,,羊只來源覆蓋全國8家國家湖羊核心育種場和4家規(guī)模化湖羊種羊場的基因組選擇參考群,,累計獲得了80萬條表型數(shù)據(jù)和78Tb基因組數(shù)據(jù),,繪制出包含2000萬個高質量遺傳變異位點超高分辨率的湖羊基因組遺傳變異圖譜,鑒定出飼料轉化率,、生長速度,、尾脂重、肌內脂肪等一系列重要經(jīng)濟性狀關鍵基因,。
以此為基礎,,蘭州大學王維民教授團隊聯(lián)合石家莊博瑞迪生物技術有限公司,利用大數(shù)據(jù),、生物信息學、育種學等技術,,研發(fā)出包含45052個具有代表性,、全局性、功能性SNPs位點的高性能45K基因組育種芯片“蘭大·華羊芯”,,并衍生出適于不同應用場景靈活使用的10K低密度和1K超低密度兩款配套使用的系列育種芯片,。在45052個芯片位點中囊括了自主鑒定的體重、生長速度,、飼料轉化率,、尾脂重、肌肉品質,、肋骨數(shù)等重要經(jīng)濟性狀的大效應關聯(lián)位點3177個,。“蘭大·華羊芯”配套相應的遺傳評估技術,,可用于湖羊基因組選擇育種,、重要經(jīng)濟性狀基因定位、品種鑒定,、家系劃分,、系譜校正等,。
據(jù)悉,“蘭大·華羊芯”設計和遺傳評估技術經(jīng)業(yè)內專家反復論證,,并在天津奧群牧業(yè)有限公司,、甘肅潤牧生物工程有限公司、甘肅羊如祥農業(yè)有限公司和金昌居佳生態(tài)農業(yè)有限公司等有關企業(yè)進行了近萬只羊的驗證,,其在重要經(jīng)濟性狀的選種準確性上已經(jīng)可以比肩國際同行,,我國綿羊育種中最具潛力的突破性性狀飼料轉化率的基因組預測填補了全球綿羊基因組選擇育種的空白,目前市場訂單達6.9萬張,,預計每年應用10萬張以上,,市場前景十分廣闊。
蘭州日報社全媒體記者 馬文艷
責任編輯:王旭偉
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